Die Kirchenverwaltung ist das gewählte Gremium der Pfarrei das mit H. Pfarrer Dieter Zinecker als Vorsitzendem die Kirchenstiftung Alburg St. Stephan rechtlich vertritt. Im Allgemeinen nimmt sich die Kirchenverwaltung aller technischen und organisatorischen Belange der Pfarrei an und bewältigt so vor allem die finanziellen Angelegenheiten und Aufgaben der Pfarrgemeinde. Die Hauptaufgaben der Kirchenverwaltung sind hier speziell das Aufstellen des Haushaltsplanes für das jeweils anstehende Haushaltsjahr, die Überwachung des Gesamtbudgets und die damit verbundene Entscheidungsgewalt sowohl zu Beschaffung und Unterhalt als auch zu Baumaßnahmen der Kirche. Außerdem stellt die Kirchenverwaltung die Jahresrechnung und die Kinderhausabrechnung auf, führt das Inventarverzeichnis, schließt gegebenfalls Verträge ab und beantragt bei Bedarf Zuschüsse von Seiten der öffentlichen Hand der Bischöflichen Finanzkammer. Des Weiteren ist die Kirchenverwaltung durch den Pfarrer sowie auch durch den Kirchenpfleger und das Gremium als Ganzes Entscheidungsträger bei Einstellungsgesprächen.
Die Mitglieder der Kirchenverwaltung sind folgenden Aufgabengebieten zugeordnet:
Ammer Thomas (stellv. Kirchenpfleger): Internet- und Datenschutz sowie Beauftragter für die Pfarrkirche St. Stephan (Tel.: 09421 55070)
Löw Irmi: Zuständig für den Bereich des Stephanussaals (Tel.: 09421 40733)
Immerfall Hermann (Kirchenpfleger): Zuständigkeitsbereich Kinderhaus sowie Haushaltsplanung (Tel.: 09421 30885)
Karl Ankerl: Friedhofsbeauftragte/r (Tel.: 09421 4869)
Ries Peter (Schriftführer): Pfarrfestbeauftragter (09421 33279)
Dr. Schreindorfer Benedikt: Zuständigkeitsbereich Nebenkirche Kay (Tel.: 09421 9905 0)
Dieter Zinecker (Pfarrer und Kirchenverwaltungsvorstand): Zuständig für den Bereich des Pfarrhofes (09421 31266)